当前RFID应用和发展面临着几个关键问题是标准、成本、技术和安全。标准、安全以及成本是放慢RFID普及应用脚步的主要问题。统一的标准是在全球范围内得到大规模应用的前提。而标准未得到统一，标签的成本势必也居高不下；同时，技术的不成熟也会减低中小企业采用RFID的兴趣。此外，RFID标签中保存程序与数据，也将引起一系列的安全与隐私问题。

标准

目前行业标准以及相关产品标准还不统一，电子标准签迄今为止全球也还没有正式形成一个统一的（包括各个频段）国际标准。缺乏全球统一标准已经成为阻挠RFID产业进一步发展的关键因素，而数据格式的标准问题又涉及到各个国家自身的利用和安全。出于自身利益的考虑，不同团体制定了各自的RFID标准，引起多制式、多频段的兼容性问题。这势必阻碍了未来RFID产品的互通和发展。因此，如何使这些标准相互兼容是当前RFID领域最迫切的问题。

成本

在采用RFID系统前，商家都会首先考虑投资成本所带来的回报。标准不统一，导致标签无法批量生产而成本过高，将无法应用于某些价值较低的商品。目前，只有像吉列公司那样的大批量购买，才可能使标签价格接近10美分。国内大多数制造商们靠的是低成本和低利润的市场优势。中国标准的建立，将使国内廉价劳动力得到利用，有助于包括电子标签、阅读器和天线等的制造成本的大幅度降低。

技术

虽然目前的RFID电子标签技术比较成熟，但总体上产品技术还不够成熟。例如，可导媒介对无线电信号的干扰很大，RFID标签的误读率目前约20%。误读主要是由于信号受到了干扰，出现标签在同一时间被多个读取器读取，以及阅读器在同时读取多个标签产生的标签冲突而引起的问题。因此，离大规模实际应用所要求的技术成熟程度还有一定差距。

安全

当前阶段的RFID应用还没有能够引起用户足够的重视，尽管企业和供应商都意识到安全是个问题，但考虑的重点仍然是RFID所能带来的投资回报。由于RFID标签中保存了各种应用程序和数据，而大多数的RFID系统都还没有非常可靠的安全机制对数据进行很好的保密。

安全问题可能出现在RFID系统的各个环节。例如，不法分子在使用RFID阅读器获得标签的有效信息后，可以通过伪造等方式对RFID系统进行非授权使用；抢劫、盗窃的不法分子甚至可以确定哪些货物值得他们下手。RFID芯片的可编程性、可写入也是个问题，它为不法份子破坏RFID标签信息、更改商品的价格等提供了机会。甚至，有德国安全专家称，RFID电子护照中的人个信息和文件可能会被复制和转移到其他的设备中，不法分子可能通过克隆的电子护照而得以非法进入目标国家。

先进的EPC Gen2标签比Gen1标签更先进，能够以4 种不同的速度运行。由于在遇到干扰时，RFID读取装置可以不同的频道间切换与RFID标签通信，因此这种通信方式被认为是安全的。但专业研究人员称这种Gen2标签也会受到破坏。此外，RFID技术增加了供应链的信息共享性，但信息共享无疑给数据安全带来隐患。就拿沃尔玛的RFID系统来说，它必须保护各个供应商的产品数据不会被其他供应商看到。

因此，RFID行业呼吁建立安全机构，以求在这项技术大规模应用前解决预计出现的安全隐私问题。