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英特尔、联想携手华大基因,加速新型冠状病毒基因组分析
2020/3/17 7:04:57     

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【产通社,3月16日讯】英特尔公司(Intel Corporation;NASDAQ股票代码:INTC)官网消息,其正与联想以及华大基因三家公司携手,加快COVID-19新型冠状病毒的基因组特性分析。来自英特尔及联想的专业技术与生命科学专家将通力合作,为华大基因的研究人员提供全新的大数据分析技术和计算资源,进一步提升其基因测序工具的分析能力,更高效地研究新型冠状病毒的基因组特性。 

英特尔市场营销集团副总裁兼中国区总经理王锐表示,“目前我们对这个新型冠状病毒还有很多不了解的地方。华大基因通过分析病毒基因组数据,加速对感染者的快速识别和基因组特性的研究,而这些工作需要投入巨大的计算资源,这恰恰是我们可以发挥作用的地方。因此,我们紧密携手,为正在防疫一线进行病毒研究的科学家提供更多的计算资源和专业支持,希望与狡猾的病毒赛跑,助力疫情防控,拯救更多生命。” 

联想集团高级副总裁、企业科技集团总裁童夫尧表示:“新型冠状病毒肺炎的疫情牵动着全国人民的心。联想作为全球领先的 HPC 厂商,一直致力于为生命科学研究提供计算力支持。来自英特尔及联想的大数据分析和健康与生命科学方面的专家,将整合我们的资源及专业技术,帮助解决目前面临的严峻挑战,推动健康和生命科学的发展进程。”

英特尔和联想携手为华大基因提供的技术包括一个大型高性能计算集群,可用于处理从华大DNBSEQ-T7测序系统读取的高通量数据。华大基因的研究人员将能够通过全新的高性能计算和基因组分析技术,以及英特尔和联想的相关资源和专业知识,进一步加速他们对新型冠状病毒的基因组特性研究。该技术将支持科学家研究病毒的毒性、传播模式、病原体与宿主间的相互作用,进而助力流行病学及疫苗设计研究。这些工作对于未来创建更好的诊断方法和设计有效的疫苗或其他保护性措施(例如免疫疗法)是非常必要的。

通过这项合作,华大基因将得以继续优化其新型冠状病毒检测试剂盒并获取大量有价值的信息。这些信息将有助于确定将来开发有效疫苗或治疗方法的潜在靶标。通过英特尔和联想的共同努力,联想的超算技术支持并优化了“基因组优化和可扩展性工具”(简称GOAST,首个获得英特尔精选解决方案验证的基因组分析工具),可为全基因组测序和全外显子测序的计算提供高达40倍的加速,助力华大基因优化计算过程,高效处理数据,更快地生成可靠的基因组分析成果,从而缩短科研和临床观察的时间。

在基因测序工作中,每毫升体液通常会包含数百万个不同的病毒体,而每个病毒体的基因组则包含大约30,000个DNA碱基或字母。华大基因正在对许多感染患者和疑似感染患者的微生物进行基因测序,因此这些研究工作将会生成TB级乃至PB级的海量数据。要想高效地快速处理这些重要数据,就需要采用更为先进的HPC基础架构、计算技术以及优化的基因组分析方法。

查询进一步信息,请访问官方网站http://newsroom.intel.cn。(Lisa WU, 365PR Newswire)    (完)
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